:: دوره 2، شماره 3 - ( پاییز 1400 ) ::
جلد 2 شماره 3 صفحات 21-11 برگشت به فهرست نسخه ها
طراحی و آنالیز یک سازه ایمنی‌زا جدید بر پایه سموم طبیعی در درمان سرطان با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی
سعید پیرمرادی
دکتری بیوشیمی، گروه آموزشی بیوشیمی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران
چکیده:   (337 مشاهده)
مقدمه: سرطان‌ها از رایج‌ترین بیماری‌های شناخته‌شده در سراسر جهان می‌باشد که دارای ناهمگنی‌های بافتی و ساختاری زیادی هستند که این باعث می‌شود فرایند درمان در آن‌ها با مشکل همراه باشد. سرطان سینه از معروف‌ترین آن­ها است که بسیاری از بیماران مبتلا به آن HER2 مثبت هستند. امروزه درمان‌های رایج سرطان به اندازه کافی در مهار مرگ‌ومیر افراد مؤثر نیستند. ایمونوتوکسین­ها مولکول‌های هیبرید هستند که حاوی یک قسمت ایمنی، که یک آنتی‌بادی یا یک قسمت اتصالی از آنتی‌بادی و قسمت دیگر آن یک بخش سمی است. در این مطالعه، ما به دنبال طراحی یک ایمونوتوکسین جدید، از جمله ضد گیرنده HER2، تراستوزوماب، مشتق شده از یک قطعه متغیر تک زنجیره‌ای (scFv) با اتصال به بخشی عملکردی از زهر خانواده عنکبوتیان بنام نوروتوکسین هستیم. روش‌ها: ما به ترتیب با استفاده از ProtParam، PepCalc، خصوصیات فیزیکی شیمیایی، ساختار ثانویه و حلالیت پروتئین کایمریک مورد بررسی قرار گرفت. یک مدل سه‌بعدی (3D) با استفاده از سرورهای I-TASSER از پروتئین هیبرید ایجاد شد. سپس بررسی ساختار و حلالیت آن با استفاده از PROCHECK و protein-sol ارزیابی شد. از سرور AllergenFP v.1.0 برای پیش‌بینی حساسیت به ایمونوتوکسین استفاده شد و پایداری mRNA توسط RNAfold نیز ارزیابی شد. سرانجام داکینگ بین ایمونوتوکسین و HER2 با استفاده از سرور ClusPro صورت گرفت.یافته­ها: نتایج بدست آمده از تحلیل‌ها نشان داد که پروتئین هیبرید می‌تواند یک پروتئین با ساختار ثانویه پایدار در محلول باشد و دارای ساختار سه‌بعدی قوی است و همچنین دارای mRNA با ساختار نسبتاً پایدار بود و می‌تواند به گیرنده HER2 متصل شود.نتیجه‌گیری: نتایج حاصل از ایمونوتوکسین طراحی شده بیانگر یک پروتئین پایدار و محلول با توانایی اتصال مطلوب به گیرنده‌های HER2 بود که این ویژگی‌ها آن را به عنوان یک کاندیدای ایمونوتوکسینی مناسب برای استفاده در درمان سرطان پستان تبدیل کرده است که اطمینان از آن‌ها نیازمند مطالعات و بررسی آن در فازهای بالینی می‌باشد.

واژه‌های کلیدی: سرطان، ایمونوتوکسین، بیوانفورماتیک، انتی بادی مونوکلونال
متن کامل [PDF 542 kb]   (69 دریافت)    
نوع مطالعه: كاربردي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1400/10/7 | پذیرش: 1401/4/8 | انتشار: 1401/1/10


XML   English Abstract   Print



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 2، شماره 3 - ( پاییز 1400 ) برگشت به فهرست نسخه ها